J’ai trouvé !!! Voici la solution pour exclure répertoire ou fichier, à mettre dans le champ exclusion des fichiers :
{.git/**,README.md,ftp-folder/**}
Ça exclue tout l’intérieur du répertoire et le répertoire lui même pour .git et ftp-folder ainsi que le fichier README.md.
Encore merci à @thanaus pour le plugin et l’aide.
Arthux