le process deconz tourne peut être sous root ce qui peut expliquer que la base soit sous root et pas ton user.
S’il n’y avait aucune base de donnée le plug-in Deconz devrait remonter un erreur lors de chaque synchronisation , puisqu’il accède à cette base pour afficher les équipements zigbee ou gérer le réseau (appairage, retrait, …).
Tu peux sinon remplacer la base zigbee par la copie d’une ancienne sauvegarde. Au pire tu en seras quitte pour tout ré appairer en cas de pb.
J’avais en son temps fait une réponse sur un sujet similaire ici :