Il me semble avoir déjà été confronté à ce cas mais je ne me rappelle plus les circonstances exactes.
ça ne répond pas vraiment à la demande mais si le but est de supprimer ces commandes sur une mise à jour du plugin, il est préférable de passer par la fonction plugin_update() :
plugin-template/install.php at master · jeedom/plugin-template (github.com)