La bonne pratique, ca reste une connexion ssh via le user jeedom puis un sudo 
(abus de language quand on dit qu’il faut etre root)
et repettre ce que tu as sur l’atlas doit convenir
donc juste SystemMaxUse=20M
puis systemctl restart systemd-journald
ou reboot
EDIT : via jeedom ( OS/DB >> _administration systeme), ceci doit marcher …
sudo sed -i.bak 's/^#SystemMaxUse=.*/SystemMaxUse=20M/' /etc/systemd/journald.conf
sudo sed 's/^#MaxRetentionSec=.*/MaxRetentionSec=1w/' /etc/systemd/journald.conf
puis pour vérifier
more /etc/systemd/journald.conf
et pour prendre en compte la modif
sudo systemctl restart systemd-journald