Ne surtout pas faire une double installation manuelle.
La seule manière d’installer deCONZ c’est depuis le plug in Deconz ce qui semble déjà fait puisque ta configuration Jeedom retourne que tout est OK.
Il ne te reste plus donc qu’a faire tes appairages réseau en commençant par les routeurs (les équipements alimentés sur secteur 220V comme les lampes, les prises commandées, les télérupteurs commandés, les modules de volets roulants, …) et ensuite seulement les capteurs à leur emplacement définitif (contacteur de porte, capteurs de lumière, de température, …) et de profiter de ton installation.
Au passage il faut aussi mettre à jour le firmware de ta ConBee2 qui est trop ancien pour supporter certaines fonctions ou équipements.
Pour cela voir ici en suivant strictement les étapes du tutoriel.